但是，在塞琉古任命為巴比倫尼亞總督時(shí)，他卻需要武力奪取巴比倫尼亞。原來(lái)，先前在亞歷山大大帝逝世時(shí)，由他信任的阿昌擔(dān)任巴比倫總督。不過(guò)，在佩爾狄卡斯掌權(quán)后發(fā)生了托勒密起兵反叛，于是，佩爾狄卡斯懷疑阿昌與托勒密有所勾結(jié)，因此佩爾狄卡斯在遠(yuǎn)征托勒密時(shí)，派遣他信任的麾下將領(lǐng)-多喀摩斯率領(lǐng)一小支部隊(duì)接替阿昌的職位。然而，阿昌拒絕交出巴比倫總督的職位，于是，他在接下來(lái)與多喀摩斯隨后發(fā)生戰(zhàn)斗，但最終以阿昌敗亡作收?qǐng)觥?/p>

而在之后，隨著佩爾狄卡斯被殺，塞琉古被任命為巴比倫總督后，自然就要與多喀摩斯面臨對(duì)決。因?yàn)椋m然佩爾狄卡斯敗亡，但是多喀摩斯依然要保住巴比倫總督這個(gè)職位，從而要致力于守住巴比倫尼亞這塊地盤。

于是，塞琉古在接下來(lái)，就要與多喀摩斯兵戎相見(jiàn)了。

但在接下來(lái)的戰(zhàn)斗中，由于準(zhǔn)備更加充足，加上之前跟隨亞歷山大大帝常年征戰(zhàn)而積累的豐富經(jīng)驗(yàn)，使得在這一戰(zhàn)，塞琉古體現(xiàn)出比多喀摩斯更加出色的軍事才能，這樣，塞琉古很快就取得了勝利，從而很快就打敗了多喀摩斯的軍隊(duì)，繼而攻下了巴比倫尼亞的首府-巴比倫城，而多喀摩斯在戰(zhàn)敗后倉(cāng)皇出逃。

就這樣，塞琉古在接下來(lái)進(jìn)駐巴比倫，真正意義上成為了巴比倫尼亞的總督，并在接下來(lái)奪取了巴比倫尼亞其他區(qū)域。從而統(tǒng)治了整個(gè)巴比倫尼亞行省。

而這是塞琉古第一次獨(dú)立領(lǐng)兵作戰(zhàn)，卻很快取得勝利，因此，這對(duì)于塞琉古本人可謂是意義重大的。尤其是極大的鼓舞了塞琉古，讓塞琉古覺(jué)得，他自己將來(lái)完全可以憑借著自己的才能，實(shí)現(xiàn)屬于他塞琉古自己的霸業(yè)。而巴比倫尼亞，則完全可以作為他實(shí)現(xiàn)霸業(yè)的起點(diǎn)。

但是，在塞琉古慶祝他這場(chǎng)勝利不久，塞琉古就要處理在接下來(lái)面臨的一系列問(wèn)題。

此時(shí)，雖然佩爾狄卡斯敗亡，但是，帝國(guó)的繼業(yè)者戰(zhàn)爭(zhēng)依然在如火如荼的進(jìn)行，因此，佩爾狄卡斯重要的大將-歐邁尼斯決心要為佩爾狄卡斯復(fù)仇，而且佩爾狄卡斯之前雖然樹(shù)敵眾多，但也籠絡(luò)一批支持他的部下。這些人紛紛加入歐邁尼斯的陣營(yíng)。包含先前的巴比倫總督多喀摩斯，他在被塞琉古擊敗后就逃到了歐邁尼斯的陣營(yíng)。這樣，歐邁尼斯在接下來(lái)得以聚集一支強(qiáng)大的軍隊(duì)來(lái)對(duì)抗這些繼業(yè)者們。此外，歐邁尼斯本人也有著很大的野心。他決心奪取整個(gè)亞歷山大帝國(guó)的控制權(quán)，從而，安提帕特與各個(gè)繼業(yè)者們都成為他要消滅的對(duì)象。

這樣，塞琉古就要面臨歐邁尼斯的威脅，但這個(gè)威脅對(duì)他來(lái)說(shuō)還談不上迫在眉睫。因?yàn)?，歐邁尼斯首要面臨的對(duì)手，就是負(fù)責(zé)帶兵剿滅他的安提柯。

這樣，到目前為止，塞琉古面臨的重要困難還是巴比倫尼亞當(dāng)?shù)貑?wèn)題，當(dāng)?shù)刈∶裨?jīng)在阿昌與多喀摩斯戰(zhàn)爭(zhēng)期間多支持多喀摩斯，對(duì)現(xiàn)在新任總督塞琉古忠誠(chéng)不足，加上當(dāng)?shù)丶浪緭碛泻艽蟮挠绊懥Γ捅葌愑钟胁簧俚鸟R其頓和希臘老兵，他們都曾經(jīng)是亞歷山大的軍隊(duì)，這時(shí)候這些老兵都相當(dāng)自大且不馴，因此塞琉古必須花一些時(shí)間處理這些問(wèn)題，來(lái)鞏固他在巴比倫尼亞的地位。

比如，在接下來(lái)，塞琉古用金錢和禮物來(lái)對(duì)祭司們示好。換取了這些祭司對(duì)他的好感。此外，他致力于發(fā)展巴比倫尼亞的經(jīng)濟(jì)，致力于休養(yǎng)生息，醫(yī)治在之前巴比倫尼亞因?yàn)閼?zhàn)亂帶來(lái)的創(chuàng)傷。從而，讓巴比倫尼亞當(dāng)?shù)氐靡詮闹暗膽?zhàn)亂中恢復(fù)過(guò)來(lái)，并且繼續(xù)保持著巴比倫尼亞以往的富庶。當(dāng)然，這也是建立在巴比倫尼亞原先就富庶的基礎(chǔ)上。