而安條克九世挑起的內(nèi)戰(zhàn)，將會(huì)給之后塞琉古帝國(guó)帶來(lái)深遠(yuǎn)影響。并且起到又一次把塞琉古帝國(guó)推向深淵的惡劣影響。

在其父安條克七世死于和帕提亞的戰(zhàn)爭(zhēng)后，他的伯父德米特里二世復(fù)位后，他的母親克利奧帕特拉·特阿害怕他被謀害，于是把他送往位于小亞細(xì)亞的庫(kù)齊庫(kù)斯，而這使他得到了“庫(kù)齊庫(kù)斯的”這個(gè)外號(hào)。

但是，安條克九世在后來(lái)非常覬覦巴西琉斯的位置，加上他在之后娶了托勒密八世的另一個(gè)女兒－克利奧帕特拉四世后，后者是個(gè)野心勃勃的女人，也極力慫恿丈夫奪取巴西琉斯的位置。并招募了不少外國(guó)的雇傭兵。而見(jiàn)到他同母異父的兄弟安條克八世貪圖享樂(lè)到腐化墮落后，他覺(jué)得正是個(gè)機(jī)會(huì)。

這樣，他最終于公元前116年返回?cái)⒗麃啠⑶彝ㄟ^(guò)自己招兵買馬，以及自己封地的兵力，發(fā)兵攻打安條克八世治下的敘利亞地區(qū)，而在接下來(lái)，他成功奪取敘利亞大片領(lǐng)土，從而與安條克八世幾乎瓜分了塞琉古帝國(guó)。

但這兩對(duì)兄弟彼此是敵對(duì)的，而安條克九世渴望成為塞琉古帝國(guó)唯一的巴西琉斯，于是，他繼續(xù)進(jìn)軍，直接殺到都城安條克城下。并在接下來(lái)的戰(zhàn)斗中擊敗了安條克八世的軍隊(duì)，從而攻取了安條克。

但是，安條克八世隨后聚集兵馬，發(fā)起反撲。從而使得塞琉古帝國(guó)這場(chǎng)內(nèi)戰(zhàn)越來(lái)越激烈。

原來(lái)，安條克八世雖然失去都城，但是在敘利亞依然有著領(lǐng)土和其支持的兵將，而安條克九世雖然取勝到攻取都城安條克，但是安條克九世因?yàn)閷?shí)力有限，導(dǎo)致他在接下來(lái)不能奪取安條克八世的領(lǐng)地。但這導(dǎo)致雙方在接下來(lái)一時(shí)間勢(shì)均力敵，到處于相持不下的局面。

不過(guò)，到了公元前112年，安條克八世一方占了上風(fēng)，并且因此奪回了都城安條克，而安條克九世的軍隊(duì)?wèi)?zhàn)敗后，安條克九世只能逃離安條克。

然而，安條克九世的妻子克利奧帕特拉四世卻沒(méi)來(lái)得及逃脫，從而依然留在都城安條克。

而安條克八世和他的妻子－特里菲娜在進(jìn)入安條克后，特里菲娜卻做出了一個(gè)極其殘忍的決定，那就是－要?dú)⑺雷鳛楹退竿傅挠H姐妹－克利奧帕特拉四世。

原來(lái)，特里菲娜和克利奧帕特拉四世雖然是同父同母的親姐妹，但是到后來(lái)卻彼此敵對(duì)，以至于特里菲娜非常憎恨她這個(gè)姐妹，而這也讓她在這次進(jìn)入安條克后，決定殺死她。而克利奧帕特拉四世在得知后，逃到了阿波羅神廟并且在那里避難。畢竟阿波羅神廟在當(dāng)時(shí)希臘人地位非常崇高而且不允許在神廟里殺人。

然而，特里菲娜依然要進(jìn)行這場(chǎng)殺戮，她在接下來(lái)指責(zé)克利奧帕特拉四世將外國(guó)軍隊(duì)引入塞琉古兄弟之間的爭(zhēng)端，以及之前違背她母親的意愿在埃及境外結(jié)婚。原來(lái)，克利奧帕特拉四世是通過(guò)逃婚來(lái)到了安條克九世身邊到嫁給了他。

然而，安條克八世得知后，趕忙請(qǐng)求他的妻子饒恕她的妹妹。他說(shuō)，他的祖先從來(lái)沒(méi)有如此暴力地對(duì)待過(guò)女性。然后，他補(bǔ)充說(shuō)，克利奧帕特拉四世避難的神廟是神圣的，因此他們必須尊重神靈，而且安條克八世也認(rèn)為他是在神靈的幫助下，他才贏得了那場(chǎng)勝利。

但特里菲娜卻沒(méi)有被她的丈夫說(shuō)服，從而執(zhí)意要這么做。因此，她還帶著士兵強(qiáng)行闖入神廟到殺死了克利奧帕特拉四世。而在臨死前，克利奧帕特拉四世詛咒了殺害她的這個(gè)姐妹，并且說(shuō)將來(lái)會(huì)有人為她復(fù)仇。

果然，在一年后，即公元前111年，安條克九世卷土重來(lái)，在安條克附近再次打敗了安條克八世，從而第二次攻取都城安條克。而特里菲娜，卻也如同她當(dāng)初的姐妹一樣，沒(méi)來(lái)得及逃脫從而被俘虜。

而后，安條克九世毫不留情的處決了她，并且把她作為祭品來(lái)給他遇害的妻子獻(xiàn)祭。這樣，特里菲娜為其惡行付出了代價(jià)。

不過(guò)，安條克八世也一樣從安條克逃脫，使得他在之后又得以聚集兵馬，發(fā)起反撲。

到了公元前109年，安條克八世又一次奪回安條克，安條克九世又一次被擊敗。

但是，在接下來(lái)，安條克九世依然能夠守住他的地盤。從而雙方繼續(xù)處于相持不下的局面。而塞琉古帝國(guó)也因?yàn)殡p方這些激烈的內(nèi)戰(zhàn)遭到極大的破壞從而進(jìn)一步被削弱。